突破 poly(A) 捕获局限，实现单细胞水平全转录组覆盖01

01 一个被系统性忽略的转录组维度

当前主流单细胞转录组方案基于oligo-dT引物对poly(A)尾的识别。这一策略极大推动了单细胞研究，但存在天然盲区：不含poly(A)尾的RNA分子，在常规流程中几乎不可见。当前单细胞图谱“largely capture polyadenylated transcripts while missing critical regulatory layers from noncoding RNA”[1-3]。

非poly(A) RNA并非少数派。它涵盖大量lncRNA、circRNA、miRNA、tRNA、snoRNA/snRNA、组蛋白mRNA，以及许多天然缺乏poly(A)尾的病毒转录本，参与转录调控、RNA加工、翻译和细胞命运决定等核心过程[5-6]。然而，在依赖poly(A)捕获的单细胞平台中，这些转录本在逆转录起始阶段就被系统性排除[1-3]。

更关键的是：可变剪接、融合基因、新转录本发现、病毒-宿主互作——这些课题真正想回答的生物学问题，依赖的是转录本全长或内部序列信息，而不仅仅是3’末端的UMI计数[3-4,7]。

如果你的研究涉及非编码RNA、circRNA、可变剪接、病毒转录本，或样本存在部分降解，默认的poly(A)捕获方案可能正在丢失你最关心的信号。

02 ABcellar® 单细胞全转录组：从“末端计数”到“全长捕获”

ABcellar® 单细胞全转录组采用半随机引物捕获 + 人/小鼠rRNA/mtRNA blocker封闭 + 模板切换 + 微流控单细胞标记的技术路线。核心设计逻辑：

单细胞总RNA测序研究已证明，随机引物策略对非poly(A) RNA具有高灵敏度，并可实现全长或近全长覆盖[1-3]。基于高亲和力RNA结合寡核苷酸的blocking策略已被证明高效、可重复、特异性强，仅需在RT反应中加入blocking寡核苷酸即可整合入现有方案，显著提升转录组覆盖度和复杂度[5]。方案内置的人/小鼠rRNA/mtRNA blocker设计目标是将rRNA/mtRNA占比控制在5%以下，将测序通量精准投向目标转录本。

03 全序列探索计划”：首批100例合作测试开放

参考文献[1] Salmen F, et al. High-throughput total RNA sequencing in single cells using VASA-seq. Nature Biotechnology. 2022;40:1780–1793.